协会的宗旨是：全面落实科学发展观，牢固树立服务意识，努力为会员、为行业、为政府服务。切实维护会员的合法权益，维护公平竞争的市场经济秩序，维护全行业的整体利益。做好行业自律，充分发挥沟通政府和行业之间的桥梁和纽带作用，促进我国食用菌行业协调、全面、可持续发展。
协会的主要任务是：开展行业情况调查和研究工作，协助政府主管部门进行行业管理。制定行规行约，搞好行业自律，维护公平竞争，建立和维护正常的生产、经营和市场秩序。组织行业信息交流，办好会刊和网站，为会员和行业提供信息和咨询服务。开展食用菌品种资源、基质资源的考察，加强对野生品种资源和栽培配料的合理开发利用和保护。大力推进食用菌产品深加工,做好行业新技术、新产品的鉴评和菌需品推荐工作。组织技术交流和技术合作。做好《菌类园艺工》职业培训工作，逐步推进从业人员持证上岗。加强国际交流与合作，促进企业开展对外贸易活动。积极发展餐桌经济，宣传普及食用菌食用价值、食用方法和科学知识，拓宽市场，引导消费，提高人民的健康水平。
中国是世界上最大的食用菌生产国，产量占世界总产量70%以上。中国食用菌协会作为全国性食用菌行业组织，将竭诚为会员、为行业提供全方位的服务。协会诚邀食用菌同业者的加盟，为共同把我国的食用菌产业做大做强而努力。
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